1956年，广西省人民政府正式批准成立广西省南宁中医学校、广西省梧州中医学校

1957年，广西省南宁中医学校、广西省梧州中医学校合并为广西省南宁中医学校

1958年，广西省南宁中医学校升格为广西中医专科学校

1964年广西中医专科学校升格为广西中医学院

1970年南宁医学专科学校并入，组成新的广西中医学院

1976年学校开始招收留学生

1979年学校开始培养硕士研究生

1996年学校先后与7所高校联合培养博士研究生​

2002年成立壮医药学院，开始招收中医学专业（壮医方向）本科生

2003年学校在教育部本科教学工作评估中荣获“优秀”，是广西第一所获得“优秀”等级的高校​

2012年3月，经国家教育部批准更名为广西中医药大学

2013年，广西中医药大学仙葫校区全面启用